ZaMirNET je nastao u okviru Antiratne Kampanje Hrvatske 1992. godine. Tada je pod imenom ZaMir ZG bio dio komunikacijske baze nastale za potrebe mreže udruga za mir i ljudska prava te ženska ljudska prava. Inicijalni koraci započeti su još 1991. godine uz pomoć stranih volontera, pripadnika mirovnog pokreta. i organizacija kao što su War Resisters International (WRI) i International Forum on Reconciliation (IFOR).

Prekretnica je bila 1992. godina kada su međunarodne i domaće mirovne grupe kroz projekt Communications Aid uspostavile ZaMir Transnational Network - ZTN, komunikacijsku bazu koja je u to vrijeme funkcionirala kao BBS (bulletin board system). Ključnu ulogu imao je Eric Bachman, prigovarač savjesti iz doba Vijetnamskog rata i dugogodišnji član svjetskog mirovnog pokreta. Svrha ZTN bila je omogućiti komunikaciju udrugama koje su se bavile zaštitom ljudskih prava, izbjeglicama itd. ali i omogućiti stranim i domaćim novinarima pristup necenzuriranim informacijama o zbivanjima na područjima bivše Jugoslavije zahvaćenima ratom. 

Godine 1997. ZaMir ZG mijenja ime u ZaMirNET te sa BBS sistema prelazi na rad na Internetu. Od 1999. godine registriran je kao samostalna udruga te i dalje funkcionira kao logistička podrška velikom broju građanskih kampanja i akcija u Hrvatskoj.